Указом Президента РФ №1564 от 22.11.2012 «О дальнейшем развитии ОАО «Федеральная гидрогенерирующая компания – РусГидро» Якутская ГРЭС-2 (первая очередь) включена в перечень объектов электроэнергетики Дальнего Востока, финансируемых в рамках докапитализации ПАО «РусГидро» за счет средств федерального бюджета.
21.06.2013 АО «Якутская ГРЭС-2» зарегистрировано в Едином государственном реестре юридических лиц Межрайонной инспекцией Федеральной налоговой службы № 5 по Республике Саха (Якутия) (г. Якутск) за основным государственным регистрационным номером (ОГРН) 1131447010640.